Po aktualizácií na verziu Plex vo verzii 0.9.12.7 sa stala nemilá vec, keď bolo zmenené umiestnenie priečinku s WebUi Plex-u, čo malo za následok nefungujúcu subdoménu pre Plex.
Nová cesta je:
/usr/lib/plexmediaserver/Resources/Plug-ins-7f37aa9/WebClient.bundle
Stačí aktualizovať symlink pre DocumentRoot pre subdoménu v Apache a Plex opäť funguje na svojej doméne :).